1.要注意溶劑的互溶性，不相混溶的溶劑不能用作梯度洗脫的流動(dòng)相。另外有些溶劑在一定比例內(nèi)混溶，超出范圍后就不互溶，使用時(shí)更要引起注意。 

2.當(dāng)有機(jī)溶劑和緩沖液混合時(shí)，還可能析出鹽的晶體，尤其使用磷酸鹽時(shí)需特別小心。

1.如果將含緩沖液的流動(dòng)相留在泵內(nèi)，尤其是在停泵過(guò)夜或更長(zhǎng)時(shí)間的情況下，或由于蒸發(fā)、泄漏，甚至只是由于溶液的靜置，就可能析出鹽的微細(xì)晶體，這些晶體將和上述固體微粒一樣會(huì)損壞密封環(huán)和柱塞等。 

2.因此，必須用純水將泵充分清洗后，再換成適合于色譜柱保存或有利于泵維護(hù)的溶劑（對(duì)于反相鍵合硅膠固定相，可以是甲醇或甲醇-水）。

1.壓力降低的原因則可能是管路有泄漏或堵塞。檢查堵塞或泄漏時(shí)應(yīng)逐段進(jìn)行。

在進(jìn)行梯度洗脫時(shí)，由于多種溶劑混合，而且組成不斷變化，因此帶來(lái)一些特殊問(wèn)題，必須充分重視。

一般說(shuō)來(lái)色譜柱不能反沖，除非特別指明該柱可以反沖時(shí)，才可以反沖除去留在柱頭的雜質(zhì)。否則反沖會(huì)迅速降低柱效，嚴(yán)重的甚至損壞色譜柱。

為了避免將來(lái)源于色譜系統(tǒng)的污染或樣品的污染直接進(jìn)入柱內(nèi)，從而縮短色譜柱的使用壽命，需要在進(jìn)樣器和色譜柱之間連接保護(hù)柱從而截取不溶性顆粒和吸附樣品基質(zhì)中的雜質(zhì)。使用保護(hù)柱可大大降低分析柱受污染的程度，延長(zhǎng)分析柱使用壽命。